Sciberia Lungs
0. О продукте
Sciberia Lungs - программное обеспечение для автоматизированного анализа медицинских изображений компьютерной томографии области легких. Целью обработки является автоматическое выявление инфильтративных и интерстициальных изменений, оценки объема этих изменений у пациентов с подозрением на вирусную пневмонию, в частности ассоциированную с COVID-19 (далее по тексту - модуль, ПО).
Примечание
Sciberia Lungs является системой помощи принятия врачебных решений (СППВР).
0.1. Функциональность
Функциональные характеристики программного обеспечения:
ПО оказывает помощь врачу в постановке правильного диагноза и принятии решения о дальнейшем лечении.
Имеет возможность автоматически обрабатывать поступающие КТ-изображения органов грудной клетки при установке на серверах медицинской организации [1].
Имеет возможность отправки исследований на облачный сервер Sciberia Lungs при использовании Sciberia Viewer.
Обрабатывает поступающие изображения и позволяет проводить автоматизацию процессов для задач локализации, сегментации и классификации для выявленных изменений в лёгких.
ПО увеличивает скорость анализа изображения, минимизирует возможность постановки ошибочного диагноза, ускоряет подсчет количественных характеристик.
Генерирует Secondary Capture (обработанное исследование) с результатами количественных расчетов степени тяжести поражения (по классификации КТ0-КТ4) и визуальным отображением областей легких с патологическими паттернами [2].
При выявлении инфильтративных и интерстициальных изменений, в частности ассоциированных с COVID-19, на выходе ПО выдаётся информация о степени тяжести поражения легких, количественные характеристики объема поражения легких в процентах (%): отдельно для левого лёгкого, правого лёгкого и общий процент поражения.
Генерирует Structured Report (структурированный отчет) с характеристиками исследования и количественными расчетами в случае наличия патологии [3].
Имеет веб-интерфейс мониторинга работы модуля.
Имеет возможность проводить статистику результатов работы.
Имеет возможность визуализации статистических данных.
0.2. Системные требования
Минимальные системные требования:
Без графического ускорителя |
С графическим ускорителем |
|
|---|---|---|
Процессор |
8 ядер, тактовая частота 2.0 ГГц |
8 ядер, тактовая частота 2.0 ГГц и выше |
Оперативная память |
DDR4 16 Гб |
DDR4 16 Гб |
Графический ускоритель |
Nvidia GPU 8Гб VRAM серии RTX и выше |
|
Операционная система |
Debian ядро версии 4.19 и выше |
Debian ядро версии 4.19 и выше |
Контейнеризатор приложений |
Docker 19.0.3 и вышe |
Docker 19.0.3 и вышe |
1. Установка
Установка и организация доступа осуществляется специалистами отдела технической поддержки компании Sciberia.
Установка на сервере медицинской организации (МО) (возможно серверное решение или установка на рабочем месте пользователя).
Доступ к работе предоставляется после инсталляции модуля, при которой прописывается конфигурация PACS-сервера, с которым будет взаимодействовать модуль.
Примечание
Результат обработки Sciberia Lungs является предварительным диагнозом и требует обязательной трактовки специалистом.
2. Работа с модулем
Для доступа к результатам обработки модуля на рабочем месте врача должен быть установлен любой DICOM-вьювер.
2.1. Модуль установлен на сервере
Модуль запускается по завершению установки и работает на протяжении всего времени, в течение которого сервер, на котором установлен модуль, запущен и подключен к локальной сети.
Модуль в круглосуточном непрерывном режиме проводит мониторинг наличия новых исследований области легких подходящей модальности и выполняет их анализ и обработку.
Доступен экран мониторинга работы модуля из любого используемого веб-браузерного приложения.
2.1.1. Автоматическая обработка исследований
Модуль Lungs на постоянной основе находится в ожидании новых КТ-исследований для обработки.
Исследования автоматически направляются на обработку напрямую с PACS-сервера.
При появлении в PACS-сервере нового КТ-исследования модуль осуществляет подготовку КТ-изображений для обработки, пропускает для обработки только те изображения формата DICOM модальности КТ, которые содержат изображения легких.
Примечание
Модуль осуществляет автоматическую обработку исследований сразу после их поступления в PACS-сервер.
2.1.2. Мониторинг Sciberia Lungs
Просмотр состояния работы модуля и очереди DICOM-изображений на обработку производится из любого используемого веб-браузерного приложения, находящегося в одной сети с сервером или АРМ, на котором установлен модуль Sciberia Lungs, с добавлением номера порта: 8080.
Окно просмотра статуса работы модуля:
В таблице отображается очередь исследований, которые были обработаны, на стадии обработки или направлены на обработку в модуль Sciberia Lungs.
Таблица включает в себя:
Колонка |
Описание |
|---|---|
Идентификатор исследования |
Идентификационный номер исследования. |
Статус |
Статус исследования в очереди: В очереди, Обрабатывается, Обработан |
Имеется отображение текущего подключения Адрес подключения.
Чтобы открыть окно статистики работы модуля необходимо нажать на кнопку Статистика.
Окно статистики работы модуля:
В таблице находятся все исследования, которые были обработаны модулем Sciberia Lungs.
Общее количество показывает общее количество обработанных исследований.
Таблица включает в себя:
Колонка |
Описание |
|---|---|
Идентификатор исследования |
Идентификационный номер исследования. |
Статус |
Статус обработанного исследования. |
Время обработки |
Время обработки исследования в секундах. |
Поражение |
Общий процент поражения в легких. |
Степень тяжести |
Степень тяжести поражения по КТ0-КТ4. |
Левое поражение |
Процент поражения левого легкого. |
Правое поражение |
Процент поражения правого легкого. |
Левый объем |
Объем поражения левого легкого в см3. |
Правый объем |
Объем поражения правого легкого в см3. |
Общий объем |
Общий объем поражения легких в см3. |
Дата получения обработки |
Дата получения обработки. |
Дата отправки на обработку |
Дата отправки на обработку |
Статистика статусов обработанных исследований включает в себя таблицу (в количественном и процентном соотношении) и визуализацию в виде диаграмму.
Поле |
Описание |
|---|---|
Общее |
Общее количество обработанных исследований. |
Без изменений |
Количество исследований без изменений. |
Наличие патологий |
Количество исследований с патологиями. |
Не легкие |
Количество исследований без легких. |
Ошибки |
Количество исследований с исходными ошибками. |
Примечание
Мониторинг модуля доступен только в случае размещения модуля на сервере медицинской организации.
2.2. Доступ к модулю через API
Логин и пароль для доступа в API, где расположен модуль, предоставляется компанией Sciberia.
2.2.1 Отправка исследований на обработку с помощью Sciberia Viewer
Чтобы отправить исследование на модуль обработки Sciberia Lungs выбираем нужное исследование
и нажимаем на кнопку «Отправить» 
.
Функция ручной отправки исследований на обработку доступна в программе Sciberia Viewer.
Важно
Sciberia Viewer - программное обеспечение для просмотра медицинских исследований формата DICOM, полученных с диагностического оборудования различных производителей. ПО доступно за отдельную плату.
В появившемся окне выбираем необходимый модуль для обработки исследования органов грудной клетки - «LUNGS».
При нажатии на «LUNGS» появится следующее окно:
Из списка выбираем API и необходимую серию, пишем логин и пароль API. Можно поставить галочку в ячейке «Запомнить меня». Нажимаем на кнопку «Отправить».
Примечание
В настройках Sciberia Viewer можно настроить параметры подключения к API.
На выходе после обработки представляются те же исследования с дополнительной разметкой, а также количественные характеристики.
2.3. Результат обработки
После обработки в локальном хранилище создаётся копия исходной серии с модальностью «SC» (Secondary Capture).
Примечание
Готовые результаты обработки направляются обратно в PACS-сервер, откуда пользователи смогут просматривать результаты с помощью любого DICOM-вьювера.
В случае, если ПО обнаружило паталогические паттерны, на Secondary Capture-изображении фиксируется следующая информация (обозначены соответствующими номерами):
Номер |
Описание |
|---|---|
1 |
Степень тяжести поражения лёгких (КТ0 – КТ4), определенная модулем. |
2 |
Общий процент поражения лёгких. |
3 |
Общий объем поражения лёгких. |
4 |
Процент поражения левого и правого лёгкого в отдельности, рассчитанные модулем. |
5 |
Объем поражения левого и правого лёгкого в отдельности, рассчитанные модулем. |
6 |
Участки поражения лёгких, выделенные цветом в соответствии со спектром стандарта DICOM. |
7 |
Область срезов с выявленной паталогией. |
В случае, если модуль не обнаружил патологические паттерны, на Secondary Capturе-изображение фиксируется следующая информация:
Важно
На всех изображениях новой серии присутствует текстовое сообщение, уведомляющее об обязательной трактовке специалиста: «Только для исследовательских целей».
3. Завершение работы модуля
Модуль работает в непрерывном, «фоновом» режиме, поэтому операции пользователя по завершению работы модуля не предусмотрены. Прерывание работы модуля возможно только в случае выключения сервера, на котором модуль установлен, деинсталляции, а также при его отключении системным администратором медицинской организации.