Sciberia Head
0. О продукте
Sciberia Head - программное обеспечение для автоматизированного анализа медицинских изображений компьютерной томографии области головного мозга. Целью обработки является выявление признаков острого нарушения мозгового кровообращения по геморрагическому типу с сегментацией и определением объема внутримозгового кровоизлияния (далее по тексту - модуль).
При выявлении признаков острого нарушения мозгового кровообращения выдаются данные о степени тяжести поражения головного мозга: количественные характеристики объема кровоизлияния в кубических сантиметрах (см. куб.) и локализация патологии (левое / правое полушарие).
Примечание
Sciberia Head является системой помощи принятия врачебных решений (СППВР).
0.1. Функциональность
Основной функционал:
Имеет возможность автоматически обрабатывать поступающие КТ-изображения головного мозга при установке на серверах медицинской организации [1].
Имеет возможность отправки исследований на облачный сервер Sciberia Head при использовании Sciberia Viewer.
Анализирует изображения и позволяет проводить автоматизацию процессов для задач локализации, сегментации и классификации для выявленных изменений в головном мозге.
Генерирует Secondary capture (обработанное исследование) с результатами количественных расчетов объема кровоизлияния в кубических сантиметрах (см. куб.) и визуальным отображением областей головного мозга с патологическими паттернами [2].
Генерирует Structured Report (структурированный отчет) с характеристиками исследования и количественными расчетами в случае наличия патологии [3].
Имеет веб-интерфейс мониторинга работы модуля.
Имеет возможность проводить статистику результатов работы.
Имеет возможность визуализации статистических данных.
0.2. Системные требования
Минимальные системные требования:
Без графического ускорителя  | 
С графическим ускорителем  | 
|
|---|---|---|
Процессор  | 
8 ядер, тактовая частота 2.0 ГГц  | 
8 ядер, тактовая частота 2.0 ГГц и выше  | 
Оперативная память  | 
DDR4 16 Гб  | 
DDR4 16 Гб  | 
Графический ускоритель  | 
Nvidia GPU 8Гб VRAM серии RTX и выше  | 
|
Операционная система  | 
Debian ядро версии 4.19 и выше  | 
Debian ядро версии 4.19 и выше  | 
Контейнеризатор приложений  | 
Docker 19.0.3 и вышe  | 
Docker 19.0.3 и вышe  | 
1. Установка
Установка и организация доступа осуществляется специалистами отдела технической поддержки компании Sciberia.
Установка на сервере медицинской организации (МО) (возможно серверное решение или установка на рабочем месте пользователя).
Доступ к работе предоставляется после инсталляции модуля, при которой прописывается конфигурация PACS-сервера, с которым будет взаимодействовать модуль.
Примечание
Результат обработки Sciberia Head является предварительным диагнозом и требует обязательной трактовки специалистом.
2. Работа с модулем
Для доступа к результатам обработки модуля на рабочем месте врача должен быть установлен любой DICOM-вьювер.
2.1. Модуль установлен на сервере
Модуль запускается по завершению установки и работает на протяжении всего времени, в течение которого сервер, на котором установлен модуль, запущен и подключен к локальной сети.
Модуль в круглосуточном непрерывном режиме проводит мониторинг наличия новых исследований головного мозга подходящей модальности и выполняет их анализ и обработку.
Доступен экран мониторинга работы модуля из любого используемого веб-браузерного приложения.
2.1.1. Автоматическая обработка исследований
Модуль Head на постоянной основе находится в ожидании новых КТ-исследований для обработки.
Исследования автоматически направляются на обработку напрямую с PACS-сервера.
При появлении в PACS-сервере нового КТ-исследования модуль осуществляет подготовку КТ-изображений для обработки, пропускает для обработки только те изображения формата DICOM модальности КТ, которые содержат изображения головного мозга.
Примечание
Модуль осуществляет автоматическую обработку исследований сразу после их поступления в PACS-сервер.
2.1.2. Мониторинг Sciberia Head
Просмотр состояния работы модуля и очереди DICOM-изображений на обработку производится из любого используемого веб-браузерного приложения, находящегося в одной сети с сервером или АРМ, на котором установлен модуль Sciberia Head, с добавлением номера порта: 8080.
Окно просмотра статуса работы модуля:
В таблице отображается очередь исследований, которые были обработаны, на стадии обработки или направлены на обработку в модуль Sciberia Head.
Таблица включает в себя:
Колонка  | 
Описание  | 
|---|---|
Идентификатор исследования  | 
Идентификационный номер исследования.  | 
Статус  | 
Статус исследования в очереди: В очереди, Обрабатывается, Обработан  | 
Чтобы открыть окно статистики работы модуля необходимо нажать на кнопку Статистика.
Имеется отображение текущего подключения Адрес подключения.
Окно статистики работы модуля:
В таблице находятся все исследования, которые были обработаны модулем Sciberia Head.
Общее количество показывает общее количество обработанных исследований.
Таблица включает в себя:
Колонка  | 
Описание  | 
|---|---|
Идентификатор исследования  | 
Идентификационный номер исследования.  | 
Статус  | 
Статус обработанного исследования.  | 
Поражение  | 
Объем кровоизлияния в кубических сантиметрах.  | 
Местоположение  | 
Локализация положения патологии: левое полушарие, правое полушарие.  | 
Время обработки  | 
Время обработки исследования в секундах.  | 
Начало обработки  | 
Дата и время начала обработки.  | 
Конец обработки  | 
Дата и время окончания обработки.  | 
Статистика статусов обработанных исследований включает в себя таблицу (в количественном и процентном соотношении) и визуализацию в виде диаграмму.
Поле  | 
Описание  | 
|---|---|
Общее  | 
Общее количество обработанных исследований.  | 
Без изменений  | 
Количество исследований без изменений.  | 
Наличие патологий  | 
Количество исследований с патологиями.  | 
Не голова  | 
Количество исследований без головного мозга.  | 
Ошибки  | 
Количество исследований с исходными ошибками.  | 
Примечание
Мониторинг модуля доступен только в случае размещения модуля на сервере медицинской организации.
2.2. Доступ к модулю через API
Логин и пароль для доступа в API, где расположен модуль, предоставляется компанией Sciberia.
2.2.1 Отправка исследований на обработку с помощью Sciberia Viewer
Чтобы отправить исследование на модуль обработки Sciberia Head выбираем нужное исследование
и нажимаем на кнопку «Отправить» 
.
Функция ручной отправки исследований на обработку доступна в программе Sciberia Viewer.
Важно
Sciberia Viewer - программное обеспечение для просмотра медицинских исследований формата DICOM, полученных с диагностического оборудования различных производителей. ПО доступно за отдельную плату.
В появившемся окне выбираем необходимый модуль для обработки исследования головного мозга - «HEAD».
При нажатии на «HEAD» появится следующее окно:
Из списка выбираем API и необходимую серию, пишем логин и пароль API. Можно поставить галочку в ячейке «Запомнить меня». Нажимаем на кнопку «Отправить».
Примечание
В настройках Sciberia Viewer можно настроить параметры подключения к API.
На выходе после обработки представляются те же исследования с дополнительной разметкой, а также количественные характеристики.
2.3. Результат обработки
После обработки в локальном хранилище создаётся копия исходной серии с модальностью «SC» (Secondary Capture).
Примечание
Готовые результаты обработки направляются обратно в PACS-сервер, откуда пользователи смогут просматривать результаты с помощью любого DICOM-вьювера.
В случае, если ПО обнаружило паталогические паттерны, на Secondary Capture-изображении фиксируется следующая информация (обозначены соответствующими номерами):
Номер  | 
Описание  | 
|---|---|
1  | 
Общий объем кровоизлияния (гематомы) определенная модулем.  | 
2  | 
Локализация положения патологии: левое полушарие, правое полушарие.  | 
3  | 
Вероятность в процентах:  | 
  | 
|
4  | 
Вероятный вид.  | 
5  | 
Участки поражения, выделенные цветом в соответствии со спектром стандарта DICOM.  | 
6  | 
Область срезов с выявленной паталогией.  | 
В случае, если модуль не обнаружил патологические паттерны, на Secondary Capturе-изображение фиксируется следующая информация:
Важно
На всех изображениях новой серии присутствует текстовое сообщение, уведомляющее об обязательной трактовке специалиста: «Только для исследовательских целей».
3. Завершение работы модуля
Модуль работает в непрерывном, «фоновом» режиме, поэтому операции пользователя по завершению работы модуля не предусмотрены. Прерывание работы модуля возможно только в случае выключения сервера, на котором модуль установлен, деинсталляции, а также при его отключении системным администратором медицинской организации.